Bomber At War 2 to gra opowiadająca historię pilota, który walczy w czasie wojny. Gracz wciela się w tę postać i musi wykonywać różne misje, aby zakończyć konflikt.

Na początku gry gracz otrzymuje swoją pierwszą misję. Musi zniszczyć bazę wroga, która przynosi im wiele korzyści. W tym celu musi przelecieć przez teren wroga i uniknąć ataków przeciwnika. W trakcie lotu gracz może zbierać bonusy, które ułatwiają mu zadanie.

Po wykonaniu pierwszej misji gracz otrzymuje kolejne zadania. Musi eskortować konwoje oraz niszczyć wrogie samoloty. Każda misja jest coraz trudniejsza i wymaga większych umiejętności. Gracz musi wykazać się zręcznością i sprytem, aby przeżyć.

W trakcie gry gracz ma możliwość ulepszania swojego samolotu, aby lepiej radził sobie w walce. Może również wybierać różne typy broni, w zależności od potrzeb. Wszystko to jest kluczowe, aby wygrać wojnę.

W końcu gracz dostaje ostatnie zadanie - musi zniszczyć główną bazę wroga. To najtrudniejsza misja, która wymaga odwagi i determinacji. Gracz musi przelecieć przez cały teren wroga, unikając ataków i zniszczeń. Potrzebuje całej swojej wiedzy i umiejętności, aby osiągnąć cel.

Po zakończeniu ostatniej misji gracz dowiaduje się, że wojna została wygrana. Dzięki jego wysiłkom udało się pokonać wroga i przywrócić pokój. Gracz staje się bohaterem, a jego imię zostaje wpisane do historii.